学生信,做分析,
就上凌波微课!
SeqLogo图绘制实操
在线视频

在线视频

副标题

文字介绍

文字介绍

副标题

SeqLogo可以直观清晰的反应序列偏好特征,每个位置出现的碱基或氨基酸类型反映了该位置序列的偏好性,每个字母的大小与该碱基在该位置上的出现频率成正相关。

例如,来自同型二聚体DNA结合蛋白的CAP家族的螺旋--螺旋基序。


图片1.png

1 大肠杆菌DNA结合蛋白的CAP家族的螺旋--螺旋基序。残基1-7形成第一个螺旋,残基8-11转弯,而12-20形成DNA识别螺旋。位置9处的甘氨酸对于形成转弯至关重要。位置48101519被部分或完全掩埋,因此倾向于由黑色的疏水性氨基酸填充。位置11-141720与主要凹槽中的碱基直接相互作用,对蛋白质的序列特异性结合至关重要。


这种高颜值的Seqlogo图放在论文当中,无形中更加出彩。本期凌波微课就来教大家如何通过WebLogohttp://weblogo.berkeley.edu/logo.cgi)在线网站绘制高颜值的SeqLogo具体操作上方SeqLogo图绘制实操视频~



学生信,做分析,
就上凌波微课

欢迎关注“lingboweike扫描二维码或搜索“凌波微课”公众号,马上关注我们吧!
关注后回复“入群”,加入凌波微课交流群,参与我们的课程和课下交流,更多精彩内容等你来哦~
扫码入江湖,群内有知己!