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eggNOG在线注释实操
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COGClusters of Orthologous Groups of proteins的缩写。COG数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/)选取的物种包括各个主要的系统进化谱系。每个COG家族至少由来自3个系统进化谱系的物种的蛋白所组成,所以一个COG对应于一个古老的保守结构域。构成每个COG的蛋白被假定来自于同一个祖先蛋白。进行COG数据库比对可以对预测蛋白进行功能注释、归类以及蛋白进化分析。

eggNOGevolutionary genealogy of genes:Non-supervised Orthologous Groups)数据库是NCBICOG数据库的扩展,它收集了更全面的物种和更大量的蛋白序列数据。

eggNOG官网提供了数据在线注释工具,即eggNOG-mapper

本期凌波微课我们就来看一下如何通过eggNOG-mapperhttp://eggnog5.embl.de/#/app/home)进行COG在线注释,具体操作方法戳上方视频哦~

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