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TCDB转运蛋白数据库在线注释
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聊科研

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单细胞转录组实操系列课程(七):基因集富集分析
单细胞转录组实操系列课程(六):组间差异分析及可视化
单细胞转录组实操系列课程(五):细胞类型注释
单细胞转录组实操系列课程(四):多样本整合分析
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微生物组多样性研究之三代16s rDNA全长扩增子
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云讲堂

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LorMe云讲堂精彩回放

第67讲  朱冬
中国科学院城市环境研究所副研究员,理学博士,主要从事新兴污染物(抗生素抗性基因、微塑料等)的生态毒性效应、风险评价与修复研究。以第一或通讯作者已在环境科学、土壤学、微生物生态等领域的主流期刊ISME J,Microbiome,EST,SBB上发表论文30余篇。作为项目负责人主持国家自然科学基金“优秀青年项目”和“面上项目”各1项。
第66讲  冯有智
中国科学院南京土壤研究所研究员,博士生导师。迄今在PNAS, Nature Reviews Microbiology, Science Bulletin, Microbiome, Global Change Biology, Engineering, Environmental Science & Technology, Soil Biology & Biochemistry, mBio以及土壤学报、生态学报、微生物学报等国内外主流学术期刊上发表文章120余篇,其中第一作者和通讯作者SCI文章50余篇。长期从事微生物生态学研究,重点聚焦土壤生态系统中微生物群落构建-群落结构-生态功能。基于土壤碳循环过程、应用群落生态学理论和模型、通过物种互作和关键功能微生物类群等多个层面,从生态(大数据分析)生理(验证性实验)的角度深化了(1)农田土壤地力可持续性的微生物学机制;(2)
第65讲  蒋超
浙江大学生命科学研究院研究员、博导,兼聘浙江大学附属第一医院。博士毕业于Indiana University并在Stanford University医学院遗传系精准医学中心进行博士后研究。长期致力于环境暴露组、微生物组、演化微生物、精准医学以及相关的实验和生信方法学开发等研究。已在国际知名期刊Cell、Nature、Nature Protocols、Cell Discovery、mSystems、Nature Biotechnology、Circulation Research、Genome Research、Journal of Hazardous Materials、mBio等杂志发表多篇研究论文。目前为Frontiers in Microbiology客座编辑、iMeta青年编辑和Bio-protocol编辑。
第64讲  董西洋
自然资源部第三海洋研究所研究员。于2017年从德国慕尼黑工业大学取得博士学位。后于加拿大卡尔加里大学能源生物工程与地球微生物研究组从事博士后研究。回国后受聘中山大学海洋科学学院任副教授。现供职海洋三所,主要从事深海微生物组方面的研究,重点关注深海冷泉等生态系统中微生物的生态与进化以及微生物基因资源的挖掘。以第一/通讯作者发表16篇高水平论文,包括3篇Nature Communications和2篇The ISME Journal,在Nature Microbiology和PNAS等期刊上参与发表论文10余篇。
第63讲  冯凯
博士,中国科学院生态环境研究中心特别研究助理/博士后研究人员,iMeta青年编委。从事微生物生态学和生物信息学研究,开发了微生物组网络分析平台iNAP。目前主要关注微生物分子生态网络、物种生态位宽度模型、环境微生物群落构建机制和气候变化下的微生物地理分布格局。以第一/共同第一作者在Science Bulletin,iMeta,Molecular Ecology Resources,Molecular Ecology等期刊发表学术论文8篇,合作发表论文40余篇,累计引用超1000次。
第62讲  王守创
博士,海南大学教授,博士生导师。海南省领军人才,入选中国科协青年人才托举工程和海南省“515人才工程”。Frontiers in Plant Science,热带生物学报、Metabolites编委,Beverage Plant Research青年编委。主要从事植物代谢组学技术开发及创新应用研究,利用多组学整合分析系统揭示作物代谢组的遗传和生化基础,为作物重要性状改良提供了代谢组学辅助育种新手段。部分研究成果入选 “十三五”期间农业科技标志性成果和“2019中国农业科学重大进展”,部分研究成果发表在Cell、Mol Plant、Curr Opin Plant Biol、Genome Biol、Plant Biotechnol J、Trends in Genetics等国际主流期刊上。主持国家自然科学基金、科技部重点研发计划子课题组、海南省院士团队创新平台项目,海南省重
第61讲  李乐园
博士,加拿大渥太华大学医学部副研究员。iMeta期刊青年编委、国际宏蛋白质组学学会执行委员会国际通讯员。毕业于北京航空航天大学,获生物医学工程博士学位。博士毕业后,先后于加拿大渥太华大学Daniel Figeys教授研究团队担任博士后研究员和副研究员,开展药物-肠道微生物组相互作用及宏蛋白质组学下游数据分析研究,开发RapidAIM个体肠道微生物组高通量体外药物筛选系统,并参与iMetaLab Suite宏蛋白质组学一站式工具集开发。一作/共同一作成果在Nature Communications、Microbiome、Gut Microbes、iMeta等国际高水平学术期刊发表。研究成果入选封面文章4次,累计引用1000余次,并受到包括学术新闻刊物ASBMB Today个人专访在内的广泛媒体报道。担任Journal of Proteomics,Nutrients Pro
第60讲   彭静静
理学博士、中国农业大学资源与环境学院/国家农业绿色发展研究院副教授、博士生导师。2011-2012年于中国科学院华南植物园基因工程中心助理研究员,2013-2018年于德国马普陆地微生物研究所环境基因组/转录组实验室进行博士后研究。主要研究方向为土壤微生物组功能特征与关键生物地球化学过程研究。以第一/通讯作者发表 SCI论文 20 篇,代表作包括Microbiome、mSystems、 Soil BiolBiochem 等国际高水平微生物组/土壤学期刊,SCI论文总被引超过1000次;担任国内高水平微生物组期刊iMeta青年编委和生态环境学报青年编委。
第59讲   张家超  
工学博士、教授、博士生导师。海南大学食品科学与工程学院副院长,主要研究方向为益生菌与肠道微生物互作效应及机制。近年来承担国家自然科学基金2项和省部级项目5项;以第一/通讯作者发表SCI论文51篇,代表作包括Microbiome、ISME J、Gut Microbes、J Hazard Mater、npj Biofilms and Microbiomes和mSystems等国际高水平微生物/微生态期刊,收录ESI高被引研究论文1篇(ISME J, 2015),1篇中文代表性研究论文入选2016年F5000中国精品科技期刊顶尖学术论文,出版学术专著1部,论文总被引超过3000次,H-index=33;授权国家发明专利7项;荣获海南省教学成果二等奖1项;入选海南省“南海名家”资助计划和海南省“拔尖人才”;担任国内高水平微生物组期刊iMeta (ISSN: 27
第58讲  刘永鑫
博士,中科院遗传发育所高工,iMeta期刊执行主编,宏基因组公众号创始人。目前发表论文50余篇,被引8000余次,主持国自然和中科院项目,主编专著《微生物组实验手册》,申请专利3项,获得软件著作权1项。研究方向为微生物组数据挖掘、方法开发和科学传播。合作成果在Science、Nature Biotechnology、Cell Host & Microbe 等期刊发表。参与微生物组分析平台QIIME 2开发。受邀在Protein & Cell、Current Opinion in Microbiology、遗传等杂志发表微生物组方法综述。兼职为Briefings in Bioinformatics、mSystems、Microbiology Spectrum、Bioinformatics、JGG、BMC系列、Frointers系列等10余个期刊审稿。创办
第57讲  吴凤芝
东北农业大学教授,博导。主要研究方向为设施园艺与蔬菜生理生态,主要包括设施蔬菜土壤健康保持、连作障碍防控、蔬菜生态栽培及土壤微生物学机理等。 国务院特殊津贴专家,“龙江学者”特聘教授,省杰出青年基金获得者,黑龙江省教学名师,蔬菜学黑龙江省领军人才梯队带头人,国家大宗蔬菜产业技术体系岗位科学家,农业农村部防灾减灾专家指导组成员。承担国家自然科学基金项目10项、国家星火计划和省重大项目各1项。获省部级以上科技奖励6项,其中国家科技进步二等奖和省部级科技进步一等奖各1项、二等奖4项,曾获国际化感基金会授予的化感作用研究“突出贡献奖”。发表SCI论文100余篇,其中ESI高被引3篇,出版“蔬菜连作障碍研究进展”专著2部。2014-2020年为东北农业大学园艺学兼蔬菜学学科带头人。指导的博士论文有1篇曾获全国优博论文提名,主讲的“设施园艺学”为国家级“线上线下”一流课程。
第56讲  贺志理
中山大学教授、博士生导师,南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海)首席科学家本科毕业于湖南师范大学生物系(1986年),硕士就读于中国科学院上海植物生理研究 (1989年), 于1998年获得澳大利亚国立大学哲学博士学位。贺志理博士在日本、加拿大和美国从事博士后、研究员和教授等工作,并于2017年创建了中山大学环境微生物组学研究中心,现为南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海)首席科学家, 长期致力于微生物生态学,微生物组学和生物信息学研究,创新微生物生态学研究方法,解析微生物多样性和生态系统功能的关系,探索微生物驱动的生物地球化学元素循环及其耦合机制。贺志理教授共发表高质量论文320余篇,总引用次数>21,000, H-指数为 82 (Google Scholar),是 2019 年、2020 年和 2021 年全球高被引学者(Clarivate/Web of Scien
第55讲  范陆
现任南方科技大学海洋科学与工程系助理教授(副研究员),博士生导师,独立PI,微生物信息学实验室(Lab of Microbial Informatics)负责人。毕业于浙江大学和澳大利亚新南威尔士大学,曾在澳大利亚昆士兰大学和深圳华大基因工作。研究方向包括微生物生态与进化、微生物共生、微生物组与病毒组互作、计算微生物学等。曾担任广州医科大学和昆士兰大学客座研究员。曾以第一或通讯作者,在Nature Ecology & Evolution、PNAS、ISME J,EST 等国际一流杂志上发表研究成果。曾获欧洲微生物学会(FEMS)青年科学家奖,澳大利亚新南威尔士州海洋科学最佳研究奖。
第54讲  戴传超
南京师范大学教授、博士生导师。1992年毕业于南京大学,获得理学学士学位(生物化学专业),1998年毕业于南京师范大学,获得理学硕士学位(植物学专业),2003年毕业于中国药科大学,获得博士学位(生药学)。现任中国微生物学会理事,江苏省微生物学会副理事长兼秘书长。
第53讲  蒋建东
南京农业大学生命科学学院教授/博导。江苏省“333高层次人才培养工程”第二层次培养对象人选、教育部新世纪优秀人才。主要研究领域为环境与土壤微生物学,研究方向为农药类持久性有机污染物的微生物降解与修复等,主持国家优秀青年科学基金、江苏省杰出青年基金、国家重点研发专项课题、国家自然科学基金中-以国际合作项目等,在ISME J, Microbiome, Molecular Microbiology, Environmental Microbiology等期刊上发表论文80余篇,获国家科技进步二等奖、江苏省科学技术奖一等奖、教育部技术发明二等奖等奖项,兼任中国微生物学会环境微生物学专业委员会副主任委员、中国土壤学会土壤生物与生物化学专业委员会副主任委员、International Biodeterioration & Biodegradation杂志Associate Edi
第52讲  鞠峰
西湖大学研究员、博士生导师。EMBLab 实验室负责人,浙江省海岸带环境与资源研究重点实验室副主任,浙江省杰出青年基金获得者,从事环境微生物组与生物技术领域研究。目前参编中英文专著3本,在 ISME Journal、Microbiome、Advanced Science、Environmental Science & Technology、Water Research 等知名期刊发表学术论文50余篇,引用 3600余次。担任中国工程院院刊 Engineering、Front Microbiol、 Eng Life Sci 期刊编委,以及 Crit Rev Environ Sci Technol、J Environ Sci、Environ Sci Ecotechnol、The Innovation (Cell Press)、iMeta 等期刊青年编委。曾获中国生
第51讲  宋毅
南方科技大学生物学助理教授。2017年博士毕业于复旦大学生物化学与分子生物学系,2017至2021年在英属哥伦比亚大学微生物与免疫系开展博士后研究,2021年10月入职南方科技大学生物系任助理教授。已在Nature Plants、Molecular Plant等学术期刊发表论文多篇,他引超过350次。拥有植物分子生物学与微生物组学相关背景,主要研究根系免疫调控机制以及植物塑造根际微生物组的机制。担任Frontiers in Microbiology和Frontiers in plant science审稿编辑。
第51讲  宋毅
南方科技大学生物学助理教授。2017年博士毕业于复旦大学生物化学与分子生物学系,2017至2021年在英属哥伦比亚大学微生物与免疫系开展博士后研究,2021年10月入职南方科技大学生物系任助理教授。已在Nature Plants、Molecular Plant等学术期刊发表论文多篇,他引超过350次。拥有植物分子生物学与微生物组学相关背景,主要研究根系免疫调控机制以及植物塑造根际微生物组的机制。担任Frontiers in Microbiology和Frontiers in plant science审稿编辑。
第50讲  崔中利
南京农业大学教授,江苏省杰出青年基金获得者。主要从事塑料等新型污染物微生物降解与循环利用、捕食性微生物种质资源与植物病害防控方面、黏细菌来源新型糖苷水解酶资源的研究。主持国家重点研究计划项目、国家转基因重大专项、国家自然科学基金等项目多项。任《Frontier in Microbiology》、《土壤学报》、《南京农业大学学报》编委。在ISME J、Microbiome、PNAS、Appl Environ Microbiol等杂志发表论文100余篇。
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