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Prokka是一个原核基因注释工具,可以快速注释细菌、古菌和病毒基因组,并能够生成GenBank、gff等标准格式的输出文件,能够找到并注释基因组上存在的特征(包括蛋白编码区域和RNA基因,如tRNA和rRNA)。
Stamp差异分析适用于多种类型的组间差异分析,比如微生态研究中的物种分布及丰度差异、转录组研究中的基因表达差异、宏组学研究中的功能差异等等。
科研绘图配色用的好,数据清晰又明了。凌波微课图片色系提取工具,让大家在中意的图片中获得好看的配色。工具只需上传图片就可以获得图片中的相应色号,不需要繁琐的代码就可以快速完成,简单方便还好用,结果图更炫酷、亮眼
这些表格我全都要!——多表格合并工具
划过显示屏的仙女棒是线性回归方程的线
引物设计不用愁,快速获取有门道~
“想切哪里切哪里”它就是这么好用!
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简单易学的混池测序——DeepBSA:动植物复杂性状定位新方法
DNAMAN系列专题:序列分析比对及拼接
有手就会的DNAMAN教程第一期来啦!
超好用的在线注释网站——Rast(二)
超好用的在线注释网站——Rast(一)
TBtools系列课程——SeqLogo绘制方法
AI软件实操教程(三):科研论文流程图绘制
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TCDB转运蛋白数据库在线注释
ARDB是最先整合了各种微生物中抗药基因的数据库
毒力因子数据库VFanalyzer在线注释实操
BacMet:抗菌杀生物剂和金属抗性基因在线注释
anitSMASH:微生物次级代谢产物基因簇预测与注释
蛋白结构域如何分析?试试Pfam在线注释
CAZymes在线注释——给你的基因一个功能分类
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物种单个基因序列上传NCBI
Filezilla软件FTP数据传输教程
物种基因组组装数据上传GWH公共数据库
组学原始测序数据上传GSA公共数据库
数据库的那些事儿
菌种鉴定序列上传NCBI,so easy!
手把手带你搞定微生物基因组上传NCBI!
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教学干货-FUNGuild对真菌功能预测!
CGView更新啦!给你一个定制化的基因组图谱
带你轻松搞定宏组学iPATH交互式Pathway分析
进化树终结版——iTOL的美化法则
SnapGene带你自定义绘制小基因组图谱
CGView——给你一个定制化的基因组图谱!
WebLogo--高颜值Seqlogo图,我也会做!
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聊科研

聊科研

Talk about scientific research

单细胞转录组实操系列课程(七):基因集富集分析
单细胞转录组实操系列课程(六):组间差异分析及可视化
单细胞转录组实操系列课程(五):细胞类型注释
单细胞转录组实操系列课程(四):多样本整合分析
单细胞转录组实操系列课程(三):单样本分析
单细胞转录组实操系列课程(二):各种输入文件的读取方式
微生物组多样性研究之三代16s rDNA全长扩增子
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云讲堂

云讲堂

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LorMe云讲堂精彩回放

第8讲  韦中
南京农业大学资源与环境科学学院教授、博士生导师。2015年入选中国科协首批托举人才工程计划,2019年获得国家自然科学基金委优秀青年项目资助。长期从事微生态与根际健康研究,开展根际微生态与土传病原青枯菌入侵相关工作。发现根际菌群的结构和功能特征决定着作物土传青枯病的发生,并建立了根际菌群调控的技术途径;揭示了菌群间形成相互竞争的制衡关系有利于抵御病原青枯菌入侵,阐明了微生物铁载体介导的根际细菌与病原青枯菌互作对作物健康的影响机制,并建立了高效预测抑病能力的菌群竞争互作网络模型,为根际菌群调控指明了方向和技术途径;创建了“引入竞争”和“精准靶向”的根际菌群生态调控策略,为田间根际菌群调控和防控土传病害提供了科学依据和技术途径。以第一或通讯作者在Nature Communications(2015)、mBio(2016)、Trends in Plant Scien
第7讲  马迎飞
研究员,博士生导师,合成微生物组学研究中心副主任。2009年获得中国科学院北京微生物研究所博士学位,先后在美国加州大学圣迭戈分校和纽约大学医学院从事人微生物组计划(Human Microbiome Project, HMP) 相关项目的研究。2015年加入中科院深圳先进技术研究院。课题组主要研究方向为:微生物组、噬菌体组、噬菌体合成生物学以及噬菌体防治耐药菌的应用研究。目前实验室承担国家各级研究项目包括:国自然面上、科技部重大研发专项、深圳市学科布局、技术攻关、孔雀团队等。
第6讲  高程
中科院微生物所博士,加州大学伯克利分校博士后。。。
第5讲  邓晔
中国科学院生态环境研究中心研究员,中国科学院大学岗位教授,博导。。。
第4讲  马斌
研究员,土壤学博士,浙江大学“百人计划”特聘研究员,博士生导师,浙江大学水土资源与环境研究所副所长。。。
第3讲  牛犇
现任职于东北林业大学生命科学学院/林木遗传育种国家重点实验室,教授,博士研究生导师,东北林业大学杰出青年学者引进人才
第2讲  焦硕
西北农林科技大学教授,博士生导师,获选全国博士后创新人才支持计划。
第1讲  邹建文
20年科研经历,长期从事土壤温室气体与全球变化研究,重点关注农业应对气候变化与农业固氮减排工作,学术成果丰富,在土壤碳氮与温室气体二氧化碳(CO2)、甲烷(CH4)和氧化亚氮(N2O)排放过程与机制、农田温室气体排放通量同步原位观测方法学与应用、农田温室气体排放总量的模型估算及减排对策等方面取得了重要创新成果。
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LorMe云讲堂精彩预告:

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LorMe云讲堂往期精彩回放合集

凌波微课|LorMe云讲堂第五季精彩回放‍   第五季讲师:褚海燕、李香真、黎绍鹏、杨军、王建军、时玉

凌波微课|LorMe云讲堂第四季精彩回放‍   第四季讲师:吴纪华、李琪、刘满强、陈迪马、赵杰、蒋瑀霁

凌波微课|LorMe云讲堂第三季内容回放        第三季讲师:蔡祖聪、白洋、张瑞福、陈桃、王二涛、孙波

凌波微课|LorMe云讲堂第二季精彩回放     第二季讲师:马迎飞,韦中,张全国,陈林兴,王光华,何俭

凌波微课|LorMe云讲堂第一季精彩回放     第一季讲师:邹建文,焦硕,牛犇,马斌,邓晔,高程

LorMe云讲堂国际版精彩回放

LorMe·国际讲堂第十讲
Ville-Petri Friman
LorMe·国际讲堂第九讲
Klaus Schläppi教授
LorMe·国际讲堂第八讲
Ashley Shade
LorMe·国际云讲堂第七期
Paolina
LorMe国际云讲堂第六期
Philippe Vandenkoornhuyse教授
LorMe国际云讲堂第五期
Joann K. Whalen教授
LorMe国际云讲堂第四期
Marnix H. Medema教授
LorMe国际云讲堂第三期
Elisa Korenblum博士
LorMe国际云讲堂第二期
George A. Kowalchuk
LorMe国际云讲堂第一期
沈其荣 院士
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肠道论坛精彩回放

钟山肠道讲坛第8期-王倬
中国科学院过程工程研究所化学生物工程前沿交叉研究部副主任
钟山肠道讲坛第8期-王倬
中国科学院过程工程研究所化学生物工程前沿交叉研究部副主任
钟山肠道讲坛第7期-王修启
博士,华南农业大学教授
钟山肠道讲坛第6期-付云贺
吉林大学动物医学学院教授,博导。吉林大学唐敖庆领军教授,国家自然科学基金优秀青年基金获得者,国家自然科学基金二审专家。
钟山肠道讲坛第5期-陈连民
博士,南京医科大学/江苏省人民医院教授,博导,国家高层次青年人才,江苏特聘医学专家。
钟山肠道讲坛第4期-陈卫华
华中科技大学教授、博士生导师。
钟山肠道讲坛第3期-邱强
西北工业大学生态环境学院教授,国家杰出青年基金获得者。
钟山肠道讲坛第2期-梁冠翔
清华大学医学院研究员,清华-北大生命科学联合中心研究员,博士生导师,入选国家高层次引进人才项目。
钟山肠道讲坛第1期-朱伟云
南京农业大学动物科学部主任委员、教授,江苏省消化道营养与动物健康重点实验室主任、江苏省动物消化道基因组国际合作联合实验室主任、动物消化道营养国家级国际联合研究中心主任。
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肠道论坛精彩预告

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