单细胞转录组实操系列课程（七）：基因集富集分析

单细胞转录组实操系列课程（六）：组间差异分析及可视化

单细胞转录组实操系列课程（五）：细胞类型注释

单细胞转录组实操系列课程（四）：多样本整合分析

单细胞转录组实操系列课程（三）：单样本分析

单细胞转录组实操系列课程（二）：各种输入文件的读取方式

微生物组多样性研究之三代16s rDNA全长扩增子

第25讲 褚海燕
中国科学院南京土壤研究所研究员，中国科学院大学土壤生物学首席教授。2000年于中国科学院南京土壤研究所获博士学位并留所工作。2001-2010年期间在日本国际农林水产业研究中心、日本国立农业环境技术研究所、加拿大Queen’s University累计工作了7年。长期从事土壤微生物学、微生物生态学方面的研究工作，重点研究土壤微生物群落的时空分布，微生物群落与功能对全球变化及农业管理的响应。发表SCI论文131篇，其中第一或通讯作者论文83篇。担任Microbiome,The ISME Journal、mSystems，Environmental Microbiology等7种国际期刊编委，国内英文期刊Soil Ecology Letters共同主编。担任中国土壤学会土壤生物与生化专业委员会主任委员，中国微生物学会农业微生物专业委员会委员，中国地理学会生物地理专业委员会委员

第24讲  蒋瑀霁
中国科学院南京土壤研究所研究员，博士生导师。国家优秀青年基金和江苏省杰出青年基金获得者，入选中国科学院青年创新促进会会员。长期从事农田生态系统土壤动物捕食机制与养分调控，食物网生态与土壤健康提升机制等研究。研究成果完善了对土壤动物捕食机制与养分循环调控原理的认识，为提升红壤中低产田地力和土壤健康建立了生物网络调控的新方向。以第一/通讯作者在Nature Communcations, ISME J,Microbiome, Environmental Microbiology和SoilBiology & Biochemistry等国际期刊发表SCI论文30余篇，授权国家发明专利2项。现任中国土壤学会青年工作委员会委员，Agriculture Ecosystems& Environment客座编辑，《土壤学报》和《应用生态学报》编委。

第23讲  赵杰
中国科学院亚热带农业生态研究所，博士，研究员。研究方向是土壤生态学和恢复生态学，主要围绕土壤微生物群落和线虫群落组成状况及功能、地上-地下互作关系开展研究。目前主要关注我国西南喀斯特退化生态系统，基于喀斯特生态系统的退化和恢复开展研究工作。已发表SCI论文50余篇，其中以第一作者和通讯作者在Soil Biology & Biochemistry、Plant and Soil、Forest Ecology and Management等SCI期刊发表25篇。先后获得中国生态学学会青年科技奖、中科院青促会优秀会员、中科院西部学者和中科院广州分院优秀青年科技工作者等荣誉称号。

第22讲  陈迪马
三峡大学教授，博士生导师。2002年获华中农业大学淡水养殖学士学位，2006年获新疆农业大学森林经理学学硕士学位，2009年获中国科学院华南植物园土壤生态学博士学位。2009年-2019年于中国科学院植物研究所任职助理研究员和副研究员，2013年-2014年于北卡罗莱纳州立大学访问学者。

第21讲  刘满强
南京农业大学教授，博士生导师。1998年毕业于南京农业大学资环学院土壤与农业化学专业，2001年和2005年先后获得土壤学硕士和博士学位。2009-2010在丹麦哥本哈根大学进行土壤食物网结构与生态功能关系的博士后研究。

第20讲  李琪
中国科学院沈阳应用生态研究所研究员，博士生导师。主要研究方向: 土壤生态学, 植物-土壤反馈, 土壤生物多样性和生态功能。

第19讲  吴纪华
复旦大学教授、博导，生物多样性与生态工程教育部重点实验室副主任。主要从事土壤生物多样性研究，着重于地上-地下生物联系、土壤线虫群落及其对环境变化的响应、全球变化影响下的食物网动态与生态系统功能、线虫系统发育及地理分布等，发表SCI论文70余篇，包括以通讯作者在Ecology Letters, Ecology, New Phytologist, Soil Biology and Biochemistry等杂志发表论文。兼任中国生态学会稳定同位素生态学专业委员会副主任委员、中国土壤学会土壤生态学专业委员会委员，《生物多样性》《土壤》编委等；主持多项国家自然科学基金重点基金、面上基金项目、科技部支撑计划项目等。

第18讲  孙波
中国科学院南京土壤研究所研究员，博导，中科院特聘研究员；江西鹰潭国家野外站站长、农业农村部耕地保育重点实验室常务副主任、中国植物营养与肥料学会副理事长。2016年起任国家“化肥农药减施增效”重点专项“耕地地力影响化肥养分利用的机制与调控”项目首席。

第17讲  王二涛
中国科学院植物生理生态研究所研究员，博士生导师，“国家杰出青年基金”获得者，主要从事豆科植物-根瘤共生固氮，植物-丛枝菌根真菌共生方面的研究。建立以脂肪酸为核心的植物-丛枝菌根真菌共生营养交换与调控的理论模型；发现菌根因子受体及受体复合，并解析了菌根因子信号转导途径等，相关研究成果发表在Science, Nature, Molecular Plant, The Plant Cell, Cell Research等国际主流学术期刊上，对植物-微生物共生研究领域有重要影响。目前任Science Bulletin, New Phytologist等学术期刊编委。获2014年“国家自然科学奖二等奖”，2018年“中国青年科技奖”，2019年“CSPB杰出青年科学家奖”和2020年“科学探索奖”等。

第16讲  陈桃
陈桃，华中农业大学植物科学技术学院，副教授。本硕博均毕业于华中农业大学生命科学技术学院，2012年获得华中农业大学理学博士学位，师从张忠明教授，从事共生固氮分子生物学研究。2012年7月至今一直在华中农业大学植物科学技术学院从事教学与科研工作，是姜道宏教授分子植物病理学团队的一员。2017年7月-2020年6月到密歇根州立大学何胜洋院士实验室做访问学者。

第15讲  张瑞福
南京农业大学资源与环境科学学院教授，博士生导师，钟山首席教授。主要从事根际微生物与微生物肥料、农业有机废弃物微生物转化与有机肥料等方面的研究。

第14讲  白洋
研究员，中国科学院遗传与发育生物学研究所、中国科学院-英国约翰英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心 (CEPAMS)。2010年德国科隆大学，获得博士学位。2011-2016年进入德国马克斯普朗克植物育种研究所开展根系微生物组与植物互作的博士后研究。2016年5月至今，在中国科学院遗传与发育生物学研究所任研究员。入选中组部“青年海外高层次人才引进”，入选科技部科技创新领军人才。任New Phytologist、Journal of Integrative Plant Biology, Soil Ecology Letters编委会成员。主要从事植物与微生物组互作的分子机制研究。在Science、Nature、Nature Biotechnology、ISME Journal等国际主流学术期刊上发表SCI论文20余篇，并在Current Opinion in Microb

第13讲  蔡祖聪
南京师范大学地理科学学院教授、博士生导师。1982年毕业于浙江农业大学，分别于1985年和1988年在中国科学院南京土壤研究所获硕士和博士学位。1985-2011年供职于南京土壤研究所，1993年晋升研究员，先后任重点实验室副主任、国家重点实验室常务副主任、研究室主任、研究所学术委员会主任等。2011年受聘于南京师范大学至今。

第12讲  何俭
广州金羿噬菌体生态实验室主任。从事生物技术制药30年，曾参与并主持国家科委八五和九五攻关计划项目，主持国家一类新生物制品研（某生长因子）研发。2000年创建噬菌体专业实验室，从事噬菌体-细菌生态学研究。

第11讲  王光华
1966年生，中科院东北地理与农业生态所研究员，农田分子生态学科组组长，博士生导师，中国科学院“百人计划”入选者。主要从事黑土农田土壤微生物生态、环境细菌病毒多样性及土传病害生物防治等方面的研究工作。研究成果获得黑龙江省自然科学二等奖2项，发表学术论文200多篇，其中SCI论文近百篇，4篇论文为ESI高被引论文，SCI论文引用1500余次。担任中国科学院黑土区农业生态重点实验室副主任、黑龙江省微生物学会和植物病理学会副理事长、中国土壤学会土壤生物与生物化学专委会委员、中国微生物学会噬菌体组专委会委员，担任《植物营养与肥料学报》、《生态学杂志》、《作物与土壤》和《生物技术通报》等期刊编委。

第10讲  陈林兴
美国加州大学伯克利分校博士后，主要从事基于宏基因组学的微生物及其噬菌体的多样性和功能研究，包括进来受到广泛关注的大噬菌体研究。近5年来，以第一作者（或共同第一作者）身份在Nature Microbiology，Genome Research，ISME Journal，Current Opinion in Biotechnology，mSystems 等杂志发表论文10余篇，并在Nature 和 Nature Microbiology 等杂志上参与发表论文10余篇，引用1200+次（H-index = 14）。担任 Frontiers in Microbiology 审稿编辑，并为 ISME Journal 等多个杂志审稿。

第9讲  张全国
博士，教授。2001年在北京师范大学获生物学理学学士学位，2005年在北京师范大学获生态学理学博士学位，2008年在牛津大学获生态学哲学博士学位。2009年至今在北京师范大学工作。2012年获得自然科学基金优秀青年项目，2013年入选“万人计划”青年拔尖人才支持计划，2017年获国家杰出青年科学基金。迄今在Ecology Letters, Evolution等刊物发表论文近20篇。任《Biology Letters》、《Journal of Plant Ecology》、《生物多样性》编委。主要研究方向为实验进化生态学。

第8讲  韦中
南京农业大学资源与环境科学学院教授、博士生导师。2015年入选中国科协首批托举人才工程计划，2019年获得国家自然科学基金委优秀青年项目资助。长期从事微生态与根际健康研究，开展根际微生态与土传病原青枯菌入侵相关工作。发现根际菌群的结构和功能特征决定着作物土传青枯病的发生，并建立了根际菌群调控的技术途径；揭示了菌群间形成相互竞争的制衡关系有利于抵御病原青枯菌入侵，阐明了微生物铁载体介导的根际细菌与病原青枯菌互作对作物健康的影响机制，并建立了高效预测抑病能力的菌群竞争互作网络模型，为根际菌群调控指明了方向和技术途径；创建了“引入竞争”和“精准靶向”的根际菌群生态调控策略，为田间根际菌群调控和防控土传病害提供了科学依据和技术途径。以第一或通讯作者在Nature Communications（2015）、mBio（2016）、Trends in Plant Scien

钟山肠道讲坛第4期-陈卫华
华中科技大学教授、博士生导师。

钟山肠道讲坛第3期-邱强
西北工业大学生态环境学院教授，国家杰出青年基金获得者。

钟山肠道讲坛第2期-梁冠翔
清华大学医学院研究员，清华-北大生命科学联合中心研究员，博士生导师，入选国家高层次引进人才项目。

钟山肠道讲坛第1期-朱伟云
南京农业大学动物科学部主任委员、教授，江苏省消化道营养与动物健康重点实验室主任、江苏省动物消化道基因组国际合作联合实验室主任、动物消化道营养国家级国际联合研究中心主任。