单细胞转录组实操系列课程（七）：基因集富集分析

单细胞转录组实操系列课程（六）：组间差异分析及可视化

单细胞转录组实操系列课程（五）：细胞类型注释

单细胞转录组实操系列课程（四）：多样本整合分析

单细胞转录组实操系列课程（三）：单样本分析

单细胞转录组实操系列课程（二）：各种输入文件的读取方式

微生物组多样性研究之三代16s rDNA全长扩增子

第41讲  刘杏忠
南开大学杰出教授，中国科学院微生物研究所兼职研究员，国家杰青、“中科院百人计划”。现任国际菌物学会执委，中国植物病理学会副理事长。曾任中国菌物学会理事长亚洲菌物学会主席、真菌学国家重点实验室主任，中国科协第八届委员会委员。中国菌物学会“戴芳澜杰出贡献奖”获得者；长期从事真菌进化生物学及微生物组研究。获得包括国家科技进步二等奖等科技奖十余项。发表论文300余篇。

第40讲  姚槐应
中国科学院城市环境研究所二级研究员，博士生导师。主要以城市-城郊土壤碳氮循环过程为核心，解析土壤物理、化学与生物学过程之间的耦合机制，研究土壤温室气体排放和污染物转化的微生物机制及其调控途径，研究成果获得首届土壤学会优秀青年学者奖及宁波市科学技术奖励。在Nat Commun, Environ Microbiol, Environ Sci Technol, Soil Biol Biochem等国内外相关领域期刊发表论文100余篇，论文累计被SCI引用4000余次，论文引用率在相关科学领域进入世界前1%行列。担任Agr Ecosyst Environ, Front Microbiol等期刊副主编或编委，浙江省城市环境过程与污染控制重点实验室主任、中国土壤学会土壤环境专业委员会副主任等学术兼职。

第39讲  罗煜
浙江大学副教授，本硕博毕业于中国农业大学土壤系，一直从事土壤有机质研究，试图理解土壤微生物对碳过程的驱动机制，以第一或通讯发表论文27篇（近九成发表在中科院一区)，ESI高被引论文5篇(单篇最高引490次)，担任《应用生态学报》、Biogeosciences、European Journal of Soil Science等期刊编委。

第38讲  徐凌
中国农业大学生物学院教授、博士生导师。2014年博士毕业于中国农业大学，后赴加州大学伯克利分校从事博士后研究工作，2021年入职中国农业大学。主要从事植物微生物组的多样性和功能研究，挖掘微生物组与宿主植物间的互作关系，探究根系、叶际微生物群落对植物宿主逆境抗性、养分吸收以及生长发育的生物学功能，探索微生物组促进植物生长的潜力。近年来，主要研究成果以第一或通讯作者发表在Nature Communications (2021)、PNAS (2018、2020)、Microbiome (2021)、Nucleic Acids Research (2019) 等学术期刊。

第37讲  梁玉婷
博士，中国科学院南京土壤研究所研究员，博士生导师。清华大学学士、博士，University of Oklahoma访问学者、博士后。从事土壤微生物学领域的研究，近年来在农田土壤微生物组功能与稳定机制方面取得了较为系统的研究成果,揭示了我国不同气候带典型农田土壤中微生物群落结构特征及碳氮耦合转化、地力提升功能的演变规律等。近年来在ISME J，Environ Sci Tech，《土壤学报》等国内外期刊上发表相关论文70余篇。承担国家自然科学优秀青年基金、江苏省杰出青年科学基金等，担任《土壤学报》、Soil Ecology Letters等编委，中国土壤学会土壤质量标准化委员会主任、江苏省土壤学会学术工作委员会主任。

第36讲   杨云锋
清华大学环境学院教授、环境模拟与污染控制国家重点联合实验室研究员。国家杰出青年科学基金项目获得者。

第35讲  李荣
博士，教授、博导。南京农业大学资源与环境科学学院副院长。目前主要从事固体废弃物资源化利用、土传病害防控、土壤微生物生态、微生物与植物互作机制等方面研究。

第34讲  刘洪伟
博士，毕业于澳大利亚昆士兰大学。长期致力于免耕农业，植物微生物互作用和昆虫肠道微生物方面的研究，目的在于揭示农业微生物与植物，昆虫之间相互作用机制以及利用微生物促进可持续发展农业。从2017年开始，在西悉尼大学从事博士后研究，其研究的利用ACC改良盐碱性土壤方法在澳洲境内获得了广泛关注和报道。先后发表相关论文30余篇，以第一作者身份在Trends in Ecology &Evolution, Trends in Plant Science, New Phytologist，Geoderma 上发表多篇论文。目前担任Journal of SustainableAgriculture and Environment期刊编委。

第33讲  吴永红
中国科学院南京土壤研究所研究员、博士生导师

第32讲  张俊伶
中国农业大学资源与环境学院，教授，博士生导师

第31讲  蔡鹏
华中农业大学资源与环境学院，教授，副院长

第30讲  时玉
中国科学院南京土壤研究所副研究员。主要研究方向为土壤微生物的生物地理分布及其生态功能。重点关注大尺度下极端环境土壤与农田土壤微生物的分布格局及其驱动机制、制作土壤微生物分布图、预测其动态变化，揭示土壤微生物群落构建模式，挖掘土壤核心菌群的生态功能。主持和参与国家自然科学基金，中国科学院战略先导专项，科技部全球气候变化重大专项，科技部基础性工作专项，科技部重点研发等项目。

第29讲  王建军
中国科学院南京地理与湖泊研究所研究员，博士生导师。研究方向为水域微生物生态学与全球变化。在微生物群落及功能的海拔梯度分布格局、微生物群落构建机制、微生物对全球变化的响应等领域开发了新的研究方法并取得原创性成果。相关成果发表在Nature Communications、Microbiome、ISME J、Global Ecology and Biogeography、Environmental Microbiology、Ecography等国际期刊，获发明专利3项；被Nature Reviews Microbiology、PNAS等期刊论文引用。获得Publons同行评议奖、江苏省科学技术奖一等奖等。任中国生态学学会淡水生态专业委员会委员，中国生态学会微生物生态专业委员会委员，Functional Ecology等期刊编委。

第28讲  杨军
中国科学院城市环境研究所研究员，从事内陆水体生态学研究，重点研究浮游生物群落时空格局、演变过程和调控机制；承担基金委、科技部、中科院、福建省等科研项目20多项，获得厦门市杰出青年基金和福建省杰出青年基金资助，在ISME J、Microbiome、Water Res、Environ Int、EST等环境与生态领域发表SCI论文89篇，对浮游生物稀有种的研究结果入选ISME J高引用论文。担任福建省流域生态重点实验室主任、中国科学院城市环境与健康重点实验室副主任、中国生态学学会淡水生态专业委员会委员、中国动物学会原生动物学分会理事、中国海洋湖沼学会湖泊分会理事。担任Microbiome、Environmental Microbiome、European Journal of Ecology、Scientific Reports、《水生生物学报》和《湖泊科学》编委；Divers

第27讲  黎绍鹏
华东师范大学研究员，博士生导师。主要研究方向为植物和微生物的构建机制。尝试从群落生态学经典理论出发，阐明群落演替、生物入侵和生境片段化背景下的生物多样性维持机制。目前主要以杭州千岛湖作为模系统，研究土壤细菌和真菌的岛屿生物地理格局和内在驱动机制。相关研究成果发表在Ecology Letters (3篇)、The ISME Journal （2篇）和Journal of Applied Ecology (2篇)等生态学经典期刊，担任Journal of Plant Ecology编委。

第26讲  李香真
中国科学院成都生物所研究员，博士生导师。主要从事废弃物厌氧生物处理技术、环境基因组学及土壤微生物方面的研究工作。在土壤微生物研究中，重点研究了中国草原土壤微生物的空间分布格局、动态变化及其功能特征，揭示了影响微生物群落结构与功能变异的关键环境因子，建设了微生物组数据库。在厌氧发酵方面，研究揭示了畜禽废弃物厌氧发酵过程中微生物群落的结构及其共发生关系，阐明了温度、活性炭材料等影响生物甲烷系统发酵效率的微生物学机制；发现了硫还原细菌氢气代谢中的电子传递跨膜蛋白。发表论文150多篇。现担任Soil Ecology Letters编委。

第25讲 褚海燕
中国科学院南京土壤研究所研究员，中国科学院大学土壤生物学首席教授。2000年于中国科学院南京土壤研究所获博士学位并留所工作。2001-2010年期间在日本国际农林水产业研究中心、日本国立农业环境技术研究所、加拿大Queen’s University累计工作了7年。长期从事土壤微生物学、微生物生态学方面的研究工作，重点研究土壤微生物群落的时空分布，微生物群落与功能对全球变化及农业管理的响应。发表SCI论文131篇，其中第一或通讯作者论文83篇。担任Microbiome,The ISME Journal、mSystems，Environmental Microbiology等7种国际期刊编委，国内英文期刊Soil Ecology Letters共同主编。担任中国土壤学会土壤生物与生化专业委员会主任委员，中国微生物学会农业微生物专业委员会委员，中国地理学会生物地理专业委员会委员

第24讲  蒋瑀霁
中国科学院南京土壤研究所研究员，博士生导师。国家优秀青年基金和江苏省杰出青年基金获得者，入选中国科学院青年创新促进会会员。长期从事农田生态系统土壤动物捕食机制与养分调控，食物网生态与土壤健康提升机制等研究。研究成果完善了对土壤动物捕食机制与养分循环调控原理的认识，为提升红壤中低产田地力和土壤健康建立了生物网络调控的新方向。以第一/通讯作者在Nature Communcations, ISME J,Microbiome, Environmental Microbiology和SoilBiology & Biochemistry等国际期刊发表SCI论文30余篇，授权国家发明专利2项。现任中国土壤学会青年工作委员会委员，Agriculture Ecosystems& Environment客座编辑，《土壤学报》和《应用生态学报》编委。

LorMe·国际讲堂第八讲
Ashley Shade

LorMe·国际云讲堂第七期
Paolina

LorMe国际云讲堂第六期
Philippe Vandenkoornhuyse教授

LorMe国际云讲堂第五期
Joann K. Whalen教授

LorMe国际云讲堂第四期
Marnix H. Medema教授

LorMe国际云讲堂第三期
Elisa Korenblum博士

钟山肠道讲坛第5期-陈连民
博士，南京医科大学/江苏省人民医院教授，博导，国家高层次青年人才，江苏特聘医学专家。

钟山肠道讲坛第4期-陈卫华
华中科技大学教授、博士生导师。

钟山肠道讲坛第3期-邱强
西北工业大学生态环境学院教授，国家杰出青年基金获得者。

钟山肠道讲坛第2期-梁冠翔
清华大学医学院研究员，清华-北大生命科学联合中心研究员，博士生导师，入选国家高层次引进人才项目。

钟山肠道讲坛第1期-朱伟云
南京农业大学动物科学部主任委员、教授，江苏省消化道营养与动物健康重点实验室主任、江苏省动物消化道基因组国际合作联合实验室主任、动物消化道营养国家级国际联合研究中心主任。