单细胞转录组实操系列课程（五）：细胞类型注释

单细胞转录组实操系列课程（四）：多样本整合分析

单细胞转录组实操系列课程（三）：单样本分析

单细胞转录组实操系列课程（二）：各种输入文件的读取方式

微生物组多样性研究之三代16s rDNA全长扩增子

单细胞转录组实操系列课程(一)：什么是单细胞转录组测序？

MER：原生生物18S rRNA引物数据库

第29讲  王建军
中国科学院南京地理与湖泊研究所研究员，博士生导师。研究方向为水域微生物生态学与全球变化。在微生物群落及功能的海拔梯度分布格局、微生物群落构建机制、微生物对全球变化的响应等领域开发了新的研究方法并取得原创性成果。相关成果发表在Nature Communications、Microbiome、ISME J、Global Ecology and Biogeography、Environmental Microbiology、Ecography等国际期刊，获发明专利3项；被Nature Reviews Microbiology、PNAS等期刊论文引用。获得Publons同行评议奖、江苏省科学技术奖一等奖等。任中国生态学学会淡水生态专业委员会委员，中国生态学会微生物生态专业委员会委员，Functional Ecology等期刊编委。

第28讲  杨军
中国科学院城市环境研究所研究员，从事内陆水体生态学研究，重点研究浮游生物群落时空格局、演变过程和调控机制；承担基金委、科技部、中科院、福建省等科研项目20多项，获得厦门市杰出青年基金和福建省杰出青年基金资助，在ISME J、Microbiome、Water Res、Environ Int、EST等环境与生态领域发表SCI论文89篇，对浮游生物稀有种的研究结果入选ISME J高引用论文。担任福建省流域生态重点实验室主任、中国科学院城市环境与健康重点实验室副主任、中国生态学学会淡水生态专业委员会委员、中国动物学会原生动物学分会理事、中国海洋湖沼学会湖泊分会理事。担任Microbiome、Environmental Microbiome、European Journal of Ecology、Scientific Reports、《水生生物学报》和《湖泊科学》编委；Divers

第27讲  黎绍鹏
华东师范大学研究员，博士生导师。主要研究方向为植物和微生物的构建机制。尝试从群落生态学经典理论出发，阐明群落演替、生物入侵和生境片段化背景下的生物多样性维持机制。目前主要以杭州千岛湖作为模系统，研究土壤细菌和真菌的岛屿生物地理格局和内在驱动机制。相关研究成果发表在Ecology Letters (3篇)、The ISME Journal （2篇）和Journal of Applied Ecology (2篇)等生态学经典期刊，担任Journal of Plant Ecology编委。

第26讲  李香真
中国科学院成都生物所研究员，博士生导师。主要从事废弃物厌氧生物处理技术、环境基因组学及土壤微生物方面的研究工作。在土壤微生物研究中，重点研究了中国草原土壤微生物的空间分布格局、动态变化及其功能特征，揭示了影响微生物群落结构与功能变异的关键环境因子，建设了微生物组数据库。在厌氧发酵方面，研究揭示了畜禽废弃物厌氧发酵过程中微生物群落的结构及其共发生关系，阐明了温度、活性炭材料等影响生物甲烷系统发酵效率的微生物学机制；发现了硫还原细菌氢气代谢中的电子传递跨膜蛋白。发表论文150多篇。现担任Soil Ecology Letters编委。

第25讲 褚海燕
中国科学院南京土壤研究所研究员，中国科学院大学土壤生物学首席教授。2000年于中国科学院南京土壤研究所获博士学位并留所工作。2001-2010年期间在日本国际农林水产业研究中心、日本国立农业环境技术研究所、加拿大Queen’s University累计工作了7年。长期从事土壤微生物学、微生物生态学方面的研究工作，重点研究土壤微生物群落的时空分布，微生物群落与功能对全球变化及农业管理的响应。发表SCI论文131篇，其中第一或通讯作者论文83篇。担任Microbiome,The ISME Journal、mSystems，Environmental Microbiology等7种国际期刊编委，国内英文期刊Soil Ecology Letters共同主编。担任中国土壤学会土壤生物与生化专业委员会主任委员，中国微生物学会农业微生物专业委员会委员，中国地理学会生物地理专业委员会委员

第24讲  蒋瑀霁
中国科学院南京土壤研究所研究员，博士生导师。国家优秀青年基金和江苏省杰出青年基金获得者，入选中国科学院青年创新促进会会员。长期从事农田生态系统土壤动物捕食机制与养分调控，食物网生态与土壤健康提升机制等研究。研究成果完善了对土壤动物捕食机制与养分循环调控原理的认识，为提升红壤中低产田地力和土壤健康建立了生物网络调控的新方向。以第一/通讯作者在Nature Communcations, ISME J,Microbiome, Environmental Microbiology和SoilBiology & Biochemistry等国际期刊发表SCI论文30余篇，授权国家发明专利2项。现任中国土壤学会青年工作委员会委员，Agriculture Ecosystems& Environment客座编辑，《土壤学报》和《应用生态学报》编委。

第23讲  赵杰
中国科学院亚热带农业生态研究所，博士，研究员。研究方向是土壤生态学和恢复生态学，主要围绕土壤微生物群落和线虫群落组成状况及功能、地上-地下互作关系开展研究。目前主要关注我国西南喀斯特退化生态系统，基于喀斯特生态系统的退化和恢复开展研究工作。已发表SCI论文50余篇，其中以第一作者和通讯作者在Soil Biology & Biochemistry、Plant and Soil、Forest Ecology and Management等SCI期刊发表25篇。先后获得中国生态学学会青年科技奖、中科院青促会优秀会员、中科院西部学者和中科院广州分院优秀青年科技工作者等荣誉称号。

第22讲  陈迪马
三峡大学教授，博士生导师。2002年获华中农业大学淡水养殖学士学位，2006年获新疆农业大学森林经理学学硕士学位，2009年获中国科学院华南植物园土壤生态学博士学位。2009年-2019年于中国科学院植物研究所任职助理研究员和副研究员，2013年-2014年于北卡罗莱纳州立大学访问学者。

第21讲  刘满强
南京农业大学教授，博士生导师。1998年毕业于南京农业大学资环学院土壤与农业化学专业，2001年和2005年先后获得土壤学硕士和博士学位。2009-2010在丹麦哥本哈根大学进行土壤食物网结构与生态功能关系的博士后研究。

第20讲  李琪
中国科学院沈阳应用生态研究所研究员，博士生导师。主要研究方向: 土壤生态学, 植物-土壤反馈, 土壤生物多样性和生态功能。

第19讲  吴纪华
复旦大学教授、博导，生物多样性与生态工程教育部重点实验室副主任。主要从事土壤生物多样性研究，着重于地上-地下生物联系、土壤线虫群落及其对环境变化的响应、全球变化影响下的食物网动态与生态系统功能、线虫系统发育及地理分布等，发表SCI论文70余篇，包括以通讯作者在Ecology Letters, Ecology, New Phytologist, Soil Biology and Biochemistry等杂志发表论文。兼任中国生态学会稳定同位素生态学专业委员会副主任委员、中国土壤学会土壤生态学专业委员会委员，《生物多样性》《土壤》编委等；主持多项国家自然科学基金重点基金、面上基金项目、科技部支撑计划项目等。

第18讲  孙波
中国科学院南京土壤研究所研究员，博导，中科院特聘研究员；江西鹰潭国家野外站站长、农业农村部耕地保育重点实验室常务副主任、中国植物营养与肥料学会副理事长。2016年起任国家“化肥农药减施增效”重点专项“耕地地力影响化肥养分利用的机制与调控”项目首席。

第17讲  王二涛
中国科学院植物生理生态研究所研究员，博士生导师，“国家杰出青年基金”获得者，主要从事豆科植物-根瘤共生固氮，植物-丛枝菌根真菌共生方面的研究。建立以脂肪酸为核心的植物-丛枝菌根真菌共生营养交换与调控的理论模型；发现菌根因子受体及受体复合，并解析了菌根因子信号转导途径等，相关研究成果发表在Science, Nature, Molecular Plant, The Plant Cell, Cell Research等国际主流学术期刊上，对植物-微生物共生研究领域有重要影响。目前任Science Bulletin, New Phytologist等学术期刊编委。获2014年“国家自然科学奖二等奖”，2018年“中国青年科技奖”，2019年“CSPB杰出青年科学家奖”和2020年“科学探索奖”等。

第16讲  陈桃
陈桃，华中农业大学植物科学技术学院，副教授。本硕博均毕业于华中农业大学生命科学技术学院，2012年获得华中农业大学理学博士学位，师从张忠明教授，从事共生固氮分子生物学研究。2012年7月至今一直在华中农业大学植物科学技术学院从事教学与科研工作，是姜道宏教授分子植物病理学团队的一员。2017年7月-2020年6月到密歇根州立大学何胜洋院士实验室做访问学者。

第15讲  张瑞福
南京农业大学资源与环境科学学院教授，博士生导师，钟山首席教授。主要从事根际微生物与微生物肥料、农业有机废弃物微生物转化与有机肥料等方面的研究。

第14讲  白洋
研究员，中国科学院遗传与发育生物学研究所、中国科学院-英国约翰英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心 (CEPAMS)。2010年德国科隆大学，获得博士学位。2011-2016年进入德国马克斯普朗克植物育种研究所开展根系微生物组与植物互作的博士后研究。2016年5月至今，在中国科学院遗传与发育生物学研究所任研究员。入选中组部“青年海外高层次人才引进”，入选科技部科技创新领军人才。任New Phytologist、Journal of Integrative Plant Biology, Soil Ecology Letters编委会成员。主要从事植物与微生物组互作的分子机制研究。在Science、Nature、Nature Biotechnology、ISME Journal等国际主流学术期刊上发表SCI论文20余篇，并在Current Opinion in Microb

第13讲  蔡祖聪
南京师范大学地理科学学院教授、博士生导师。1982年毕业于浙江农业大学，分别于1985年和1988年在中国科学院南京土壤研究所获硕士和博士学位。1985-2011年供职于南京土壤研究所，1993年晋升研究员，先后任重点实验室副主任、国家重点实验室常务副主任、研究室主任、研究所学术委员会主任等。2011年受聘于南京师范大学至今。

第12讲  何俭
广州金羿噬菌体生态实验室主任。从事生物技术制药30年，曾参与并主持国家科委八五和九五攻关计划项目，主持国家一类新生物制品研（某生长因子）研发。2000年创建噬菌体专业实验室，从事噬菌体-细菌生态学研究。