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Prokka是一个原核基因注释工具,可以快速注释细菌、古菌和病毒基因组,并能够生成GenBank、gff等标准格式的输出文件,能够找到并注释基因组上存在的特征(包括蛋白编码区域和RNA基因,如tRNA和rRNA)。
Stamp差异分析适用于多种类型的组间差异分析,比如微生态研究中的物种分布及丰度差异、转录组研究中的基因表达差异、宏组学研究中的功能差异等等。
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这些表格我全都要!——多表格合并工具
划过显示屏的仙女棒是线性回归方程的线
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“想切哪里切哪里”它就是这么好用!
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物种基因组组装数据上传GWH公共数据库
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CGView更新啦!给你一个定制化的基因组图谱
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聊科研

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Talk about scientific research

转录组看的眼花缭乱?一文带你理清转录组项目!
国家基因组科学数据中心(NGDC)——中国人自己的数据库
单细胞转录组实操系列课程(七):基因集富集分析
单细胞转录组实操系列课程(六):组间差异分析及可视化
单细胞转录组实操系列课程(五):细胞类型注释
单细胞转录组实操系列课程(四):多样本整合分析
单细胞转录组实操系列课程(三):单样本分析
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云讲堂

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LorMe云讲堂精彩回放

第82讲  王淼啸
瑞士苏黎世联邦理工学院(ETH Zürich)博士后研究员,工作于Martin Ackermann教授和Olga Schubert研究员所领导的课题组。
第81讲  贾鹏
武汉大学资源与环境科学学院教授,公共卫生学院、人民医院、测绘遥感信息工程国家重点实验
室兼职教授,空间全生命周期健康国际研究中心主任,国家级海外高层次引进人才,湖北省“百人计划”专家,“武汉英才”产业领军人才。
第80讲  陈银
分别于2002及2005年获得清华大学学士和硕士学位,2008年获得华威大学博士学位。随后在华威大学从事博士后研究工作,2020年晋升为华威大学教授。
第79讲  程旭
博士毕业于荷兰瓦赫宁根大学,现为中国农业科学院农业基因组研究所研究员,博士生导师,获深圳市海外高层次人才。
第78讲  孙新
孙新,中国科学院城市环境研究所研究员,德国洪堡学者,中科院百人计划,博士生导师。
第77讲  袁军
南京农业大学副教授,院士助理,钟山学术新秀。
第76讲  荀卫兵
南京农业大学资源与环境科学学院副教授
第75讲  蔡磊
中国科学院微生物研究所研究员,真菌学国家重点实验室主任,基金委“杰青”、“优青”、中科院“百人计划”入选者 。
第74讲  贺纪正
福建师范大学教授,国家杰出青年基金获得者。先后任华中农业大学教授、博士生导师、系主任,中国科学院生态环境研究中心“百人计划”研究员、土壤环境研究室主任,墨尔本大学教授。
第73讲  程磊
浙江大学“求是特聘”教授
第72讲  戴磊
中国科学院深圳先进技术研究院研究员,合成微生物组学研究中心主任。国家重点研发计划青年项目负责人,入选《麻省理工科技评论》中国区“35岁以下科技创新35人”。
第71讲  崔丽
中科院城市环境研究所,研究员,博导,国家优青。厦门大学学士和博士,英国牛津大学、兰卡斯特大学和瑞士伯尔尼大学访问学者。
第70讲  胡脊梁
麻省理工学院独立博士后研究员。在清华大学钱学森班取得学士学位,在MIT物理系Jeff Gore教授指导下取得PhD学位,目前是MIT Physics of Living System独立博士后研究员。
第69讲  宁康
华中科技大学生命科学与技术学院教授,博士生导师。毕业于新加坡国立大学计算机专业,博士后工作于美国密歇根大学,现为华中科技大学大学生命科学与技术学院教授、博士生导师,生物信息与系统生物学系系主任。
第68讲  陆雅海
北京大学博雅特聘教授,国家杰出青年基金获得者。
第67讲  朱冬
中国科学院城市环境研究所副研究员,理学博士
第66讲  冯有智
中国科学院南京土壤研究所研究员,博士生导师。
第65讲  蒋超
浙江大学生命科学研究院研究员、博导,兼聘浙江大学附属第一医院。博士毕业于Indiana University并在Stanford University医学院遗传系精准医学中心进行博士后研究。


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LorMe云讲堂国际版精彩回放

LorMe云讲堂国际版第十九讲
Matthias C. Rillig教授
LorMe云讲堂国际版第十八讲
Joana Falcão Salles教授
LorMe·国际讲堂第17期
Søren Sørensen
LorMe·国际讲堂第16期
Djordje Bajić
LorMe·国际讲堂第15期
Rolf Kümmerli
LorMe·国际讲堂第14期
Rolf Kümmerli
LorMe·国际讲堂第13期
Francisco Dini-Andreote
LorMe·国际讲堂第12期
Ines Mandić Mulec
LorMe·国际讲堂第11期
Omri Finkel
LorMe·国际讲堂第10期
Ville-Petri Friman
LorMe·国际讲堂第9期
Klaus Schläppi教授
LorMe·国际讲堂第8期
Ashley Shade
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肠道论坛精彩回放

肠道论坛第18讲
浙江大学“百人计划”研究员,博士生导师,动物科技系副系主任-孙会增老师
肠道论坛第17讲
特邀加拿大不列颠哥伦比亚大学、土壤与食品系统学院教授,国际知名微生物学与功能基因组学专家Leluo Guan教授
钟山肠道进坛第16讲
加拿大不列颠哥伦比亚大学、土壤与食品系统学院教授,国际知名微生物学与功能基因组学专家Leluo Guan
钟山肠道讲坛第15讲-陆晓楠
麦吉尔大学食品科学与农业化学系教授
钟山肠道讲坛第14期-徐健
中国科学院青岛生物能源与过程所研究员、生物能源室主任、单细胞中心主任;山东省能源生物遗传资源重点实验室主任
钟山肠道讲坛第13期-周晓辉
华盛顿州立大学微生学博士,现任南方科技大学长聘教授,教育部长江讲席教授。曾担任美国康涅狄格大学病原生物学系终身教授。
钟山肠道讲坛第12期-王炜
复旦大学生命科学学院、复旦微生物组中心青年研究员、课题组长。
钟山肠道讲坛第11期-王军军
中国农业大学动物科技学院教授、副院长,北京畜牧兽医学会副理事长、动物营养学分会猪营养专委会主任、中国实验动物学会无菌动物专委会副主任,为国家杰出青年科学基金获得者、国家重点研发计划项目负责人、国家生猪产业技术体系岗位科学家,担任Animal Nutrition副主编、Animal Models and Experimental Medicine执行主编、 Journal of Animal Science and Biotechnology编委。
钟山肠道讲坛第10期-李志鹏
吉林农业大学动物科学技术学院(动物医学院)副院长,教授,博士生导师,国家优秀青年科学基金获得者。
钟山肠道讲坛第9期-刘永鑫
中国农科院基因组所研究员,iMeta期刊执行主编,宏基因组公众号创始人
钟山肠道讲坛第8期-王倬
中国科学院过程工程研究所化学生物工程前沿交叉研究部副主任
钟山肠道讲坛第7期-王修启
博士,华南农业大学教授
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