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Prokka是一个原核基因注释工具,可以快速注释细菌、古菌和病毒基因组,并能够生成GenBank、gff等标准格式的输出文件,能够找到并注释基因组上存在的特征(包括蛋白编码区域和RNA基因,如tRNA和rRNA)。
Stamp差异分析适用于多种类型的组间差异分析,比如微生态研究中的物种分布及丰度差异、转录组研究中的基因表达差异、宏组学研究中的功能差异等等。
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这些表格我全都要!——多表格合并工具
划过显示屏的仙女棒是线性回归方程的线
引物设计不用愁,快速获取有门道~
“想切哪里切哪里”它就是这么好用!
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简单易学的混池测序——DeepBSA:动植物复杂性状定位新方法
DNAMAN系列专题:序列分析比对及拼接
有手就会的DNAMAN教程第一期来啦!
超好用的在线注释网站——Rast(二)
超好用的在线注释网站——Rast(一)
TBtools系列课程——SeqLogo绘制方法
AI软件实操教程(三):科研论文流程图绘制
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TCDB转运蛋白数据库在线注释
ARDB是最先整合了各种微生物中抗药基因的数据库
毒力因子数据库VFanalyzer在线注释实操
BacMet:抗菌杀生物剂和金属抗性基因在线注释
anitSMASH:微生物次级代谢产物基因簇预测与注释
蛋白结构域如何分析?试试Pfam在线注释
CAZymes在线注释——给你的基因一个功能分类
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物种基因组组装数据上传GWH公共数据库
组学原始测序数据上传GSA公共数据库
物种单个基因序列上传NCBI
Filezilla软件FTP数据传输教程
数据库的那些事儿
菌种鉴定序列上传NCBI,so easy!
手把手带你搞定微生物基因组上传NCBI!
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教学干货-FUNGuild对真菌功能预测!
CGView更新啦!给你一个定制化的基因组图谱
带你轻松搞定宏组学iPATH交互式Pathway分析
进化树终结版——iTOL的美化法则
SnapGene带你自定义绘制小基因组图谱
CGView——给你一个定制化的基因组图谱!
WebLogo--高颜值Seqlogo图,我也会做!
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聊科研

聊科研

Talk about scientific research

国家基因组科学数据中心(NGDC)——中国人自己的数据库
单细胞转录组实操系列课程(七):基因集富集分析
单细胞转录组实操系列课程(六):组间差异分析及可视化
单细胞转录组实操系列课程(五):细胞类型注释
单细胞转录组实操系列课程(四):多样本整合分析
单细胞转录组实操系列课程(三):单样本分析
单细胞转录组实操系列课程(二):各种输入文件的读取方式
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云讲堂

云讲堂

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LorMe云讲堂精彩回放

第76讲  荀卫兵
南京农业大学资源与环境科学学院副教授
第75讲  蔡磊
中国科学院微生物研究所研究员,真菌学国家重点实验室主任,基金委“杰青”、“优青”、中科院“百人计划”入选者 。
第74讲  贺纪正
福建师范大学教授,国家杰出青年基金获得者。先后任华中农业大学教授、博士生导师、系主任,中国科学院生态环境研究中心“百人计划”研究员、土壤环境研究室主任,墨尔本大学教授。
第73讲  程磊
浙江大学“求是特聘”教授
第72讲  戴磊
中国科学院深圳先进技术研究院研究员,合成微生物组学研究中心主任。国家重点研发计划青年项目负责人,入选《麻省理工科技评论》中国区“35岁以下科技创新35人”。
第71讲  崔丽
中科院城市环境研究所,研究员,博导,国家优青。厦门大学学士和博士,英国牛津大学、兰卡斯特大学和瑞士伯尔尼大学访问学者。
第70讲  胡脊梁
麻省理工学院独立博士后研究员。在清华大学钱学森班取得学士学位,在MIT物理系Jeff Gore教授指导下取得PhD学位,目前是MIT Physics of Living System独立博士后研究员。
第69讲  宁康
华中科技大学生命科学与技术学院教授,博士生导师。毕业于新加坡国立大学计算机专业,博士后工作于美国密歇根大学,现为华中科技大学大学生命科学与技术学院教授、博士生导师,生物信息与系统生物学系系主任。
第68讲  陆雅海
北京大学博雅特聘教授,国家杰出青年基金获得者。
第67讲  朱冬
中国科学院城市环境研究所副研究员,理学博士
第66讲  冯有智
中国科学院南京土壤研究所研究员,博士生导师。
第65讲  蒋超
浙江大学生命科学研究院研究员、博导,兼聘浙江大学附属第一医院。博士毕业于Indiana University并在Stanford University医学院遗传系精准医学中心进行博士后研究。
第64讲  董西洋
自然资源部第三海洋研究所研究员。于2017年从德国慕尼黑工业大学取得博士学位。后于加拿大卡尔加里大学能源生物工程与地球微生物研究组从事博士后研究。回国后受聘中山大学海洋科学学院任副教授。现供职海洋三所
第63讲  冯凯
博士,中国科学院生态环境研究中心特别研究助理/博士后研究人员,iMeta青年编委。
第62讲  王守创
博士,海南大学教授,博士生导师。海南省领军人才,入选中国科协青年人才托举工程和海南省“515人才工程”。Frontiers in Plant Science,热带生物学报、Metabolites编委,Beverage Plant Research青年编委。
第61讲  李乐园
博士,加拿大渥太华大学医学部副研究员。iMeta期刊青年编委、国际宏蛋白质组学学会执行委员会国际通讯员。毕业于北京航空航天大学,获生物医学工程博士学位。博士毕业后,先后于加拿大渥太华大学Daniel Figeys教授研究团队担任博士后研究员和副研究员
第60讲   彭静静
理学博士、中国农业大学资源与环境学院/国家农业绿色发展研究院副教授、博士生导师。2011-2012年于中国科学院华南植物园基因工程中心助理研究员,2013-2018年于德国马普陆地微生物研究所环境基因组/转录组实验室进行博士后研究。
第59讲   张家超  
工学博士、教授、博士生导师。海南大学食品科学与工程学院副院长

LorMe云讲堂国际版精彩回放

LorMe·国际讲堂第17期
Søren Sørensen
LorMe·国际讲堂第16期
Djordje Bajić
LorMe·国际讲堂第15期
Rolf Kümmerli
LorMe·国际讲堂第14期
Rolf Kümmerli
LorMe·国际讲堂第13期
Francisco Dini-Andreote
LorMe·国际讲堂第12期
Ines Mandić Mulec
LorMe·国际讲堂第11期
Omri Finkel
LorMe·国际讲堂第10期
Ville-Petri Friman
LorMe·国际讲堂第9期
Klaus Schläppi教授
LorMe·国际讲堂第8期
Ashley Shade
LorMe·国际云讲堂第7期
Paolina
LorMe国际云讲堂第6期
Philippe Vandenkoornhuyse教授
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LorMe云讲堂国际版精彩预告

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肠道论坛精彩回放

钟山肠道讲坛第13期-周晓辉
华盛顿州立大学微生学博士,现任南方科技大学长聘教授,教育部长江讲席教授。曾担任美国康涅狄格大学病原生物学系终身教授。
钟山肠道讲坛第12期-王炜
复旦大学生命科学学院、复旦微生物组中心青年研究员、课题组长。
钟山肠道讲坛第11期-王军军
中国农业大学动物科技学院教授、副院长,北京畜牧兽医学会副理事长、动物营养学分会猪营养专委会主任、中国实验动物学会无菌动物专委会副主任,为国家杰出青年科学基金获得者、国家重点研发计划项目负责人、国家生猪产业技术体系岗位科学家,担任Animal Nutrition副主编、Animal Models and Experimental Medicine执行主编、 Journal of Animal Science and Biotechnology编委。
钟山肠道讲坛第10期-李志鹏
吉林农业大学动物科学技术学院(动物医学院)副院长,教授,博士生导师,国家优秀青年科学基金获得者。
钟山肠道讲坛第9期-刘永鑫
中国农科院基因组所研究员,iMeta期刊执行主编,宏基因组公众号创始人
钟山肠道讲坛第8期-王倬
中国科学院过程工程研究所化学生物工程前沿交叉研究部副主任
钟山肠道讲坛第7期-王修启
博士,华南农业大学教授
钟山肠道讲坛第6期-付云贺
吉林大学动物医学学院教授,博导。吉林大学唐敖庆领军教授,国家自然科学基金优秀青年基金获得者,国家自然科学基金二审专家。
钟山肠道讲坛第5期-陈连民
博士,南京医科大学/江苏省人民医院教授,博导,国家高层次青年人才,江苏特聘医学专家。
钟山肠道讲坛第4期-陈卫华
华中科技大学教授、博士生导师。
钟山肠道讲坛第3期-邱强
西北工业大学生态环境学院教授,国家杰出青年基金获得者。
钟山肠道讲坛第2期-梁冠翔
清华大学医学院研究员,清华-北大生命科学联合中心研究员,博士生导师,入选国家高层次引进人才项目。
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