扩增子研究第十讲：扩增子测序中的物种组成分析

扩增子研究第九讲：扩增子测序结果中的基本信息统计

扩增子研究第八讲：微生物多样性物种分类注释

扩增子研究第七讲：高通量下机数据质控标准

扩增子研究第六讲：高通量下机数据评估标准

扩增子研究第五讲：微生物群落研究建库测序流程

扩增子研究第四讲：微生物群落研究策略

扩增子研究第三讲：微生物群落研究的目的

第1讲  邹建文
20年科研经历，长期从事土壤温室气体与全球变化研究，重点关注农业应对气候变化与农业固氮减排工作，学术成果丰富，在土壤碳氮与温室气体二氧化碳（CO2）、甲烷（CH4）和氧化亚氮（N2O）排放过程与机制、农田温室气体排放通量同步原位观测方法学与应用、农田温室气体排放总量的模型估算及减排对策等方面取得了重要创新成果。

第2讲  焦硕
西北农林科技大学教授，博士生导师，获选全国博士后创新人才支持计划。

第3讲  牛犇
现任职于东北林业大学生命科学学院/林木遗传育种国家重点实验室，教授，博士研究生导师，东北林业大学杰出青年学者引进人才

第4讲  马斌
研究员，土壤学博士，浙江大学“百人计划”特聘研究员，博士生导师，浙江大学水土资源与环境研究所副所长。。。

第5讲  邓晔
中国科学院生态环境研究中心研究员，中国科学院大学岗位教授，博导。。。

第6讲  高程
中科院微生物所博士，加州大学伯克利分校博士后。。。

第7讲  马迎飞
研究员，博士生导师，合成微生物组学研究中心副主任。2009年获得中国科学院北京微生物研究所博士学位，先后在美国加州大学圣迭戈分校和纽约大学医学院从事人微生物组计划(Human Microbiome Project, HMP) 相关项目的研究。2015年加入中科院深圳先进技术研究院。课题组主要研究方向为：微生物组、噬菌体组、噬菌体合成生物学以及噬菌体防治耐药菌的应用研究。目前实验室承担国家各级研究项目包括：国自然面上、科技部重大研发专项、深圳市学科布局、技术攻关、孔雀团队等。近五年研究成果发表在Microbiome、Journal of Virology, Front. Microbiol, Scientific Reports 等国际期刊。

第8讲  韦中
南京农业大学资源与环境科学学院教授、博士生导师。2015年入选中国科协首批托举人才工程计划，2019年获得国家自然科学基金委优秀青年项目资助。长期从事微生态与根际健康研究，开展根际微生态与土传病原青枯菌入侵相关工作。发现根际菌群的结构和功能特征决定着作物土传青枯病的发生，并建立了根际菌群调控的技术途径；揭示了菌群间形成相互竞争的制衡关系有利于抵御病原青枯菌入侵，阐明了微生物铁载体介导的根际细菌与病原青枯菌互作对作物健康的影响机制，并建立了高效预测抑病能力的菌群竞争互作网络模型，为根际菌群调控指明了方向和技术途径；创建了“引入竞争”和“精准靶向”的根际菌群生态调控策略，为田间根际菌群调控和防控土传病害提供了科学依据和技术途径。以第一或通讯作者在Nature Communications（2015）、mBio（2016）、Trends in Plant Scien

第9讲  张全国
博士，教授。2001年在北京师范大学获生物学理学学士学位，2005年在北京师范大学获生态学理学博士学位，2008年在牛津大学获生态学哲学博士学位。2009年至今在北京师范大学工作。2012年获得自然科学基金优秀青年项目，2013年入选“万人计划”青年拔尖人才支持计划，2017年获国家杰出青年科学基金。迄今在Ecology Letters, Evolution等刊物发表论文近20篇。任《Biology Letters》、《Journal of Plant Ecology》、《生物多样性》编委。主要研究方向为实验进化生态学。

第10讲  陈林兴
美国加州大学伯克利分校博士后，主要从事基于宏基因组学的微生物及其噬菌体的多样性和功能研究，包括进来受到广泛关注的大噬菌体研究。近5年来，以第一作者（或共同第一作者）身份在Nature Microbiology，Genome Research，ISME Journal，Current Opinion in Biotechnology，mSystems 等杂志发表论文10余篇，并在Nature 和 Nature Microbiology 等杂志上参与发表论文10余篇，引用1200+次（H-index = 14）。担任 Frontiers in Microbiology 审稿编辑，并为 ISME Journal 等多个杂志审稿。

第11讲  王光华
1966年生，中科院东北地理与农业生态所研究员，农田分子生态学科组组长，博士生导师，中国科学院“百人计划”入选者。主要从事黑土农田土壤微生物生态、环境细菌病毒多样性及土传病害生物防治等方面的研究工作。研究成果获得黑龙江省自然科学二等奖2项，发表学术论文200多篇，其中SCI论文近百篇，4篇论文为ESI高被引论文，SCI论文引用1500余次。担任中国科学院黑土区农业生态重点实验室副主任、黑龙江省微生物学会和植物病理学会副理事长、中国土壤学会土壤生物与生物化学专委会委员、中国微生物学会噬菌体组专委会委员，担任《植物营养与肥料学报》、《生态学杂志》、《作物与土壤》和《生物技术通报》等期刊编委。

第12讲  何俭
广州金羿噬菌体生态实验室主任。从事生物技术制药30年，曾参与并主持国家科委八五和九五攻关计划项目，主持国家一类新生物制品研（某生长因子）研发。2000年创建噬菌体专业实验室，从事噬菌体-细菌生态学研究。

第13讲  蔡祖聪
南京师范大学地理科学学院教授、博士生导师。1982年毕业于浙江农业大学，分别于1985年和1988年在中国科学院南京土壤研究所获硕士和博士学位。1985-2011年供职于南京土壤研究所，1993年晋升研究员，先后任重点实验室副主任、国家重点实验室常务副主任、研究室主任、研究所学术委员会主任等。2011年受聘于南京师范大学至今。

第14讲  白洋
研究员，中国科学院遗传与发育生物学研究所、中国科学院-英国约翰英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心 (CEPAMS)。2010年德国科隆大学，获得博士学位。2011-2016年进入德国马克斯普朗克植物育种研究所开展根系微生物组与植物互作的博士后研究。2016年5月至今，在中国科学院遗传与发育生物学研究所任研究员。入选中组部“青年海外高层次人才引进”，入选科技部科技创新领军人才。任New Phytologist、Journal of Integrative Plant Biology, Soil Ecology Letters编委会成员。主要从事植物与微生物组互作的分子机制研究。在Science、Nature、Nature Biotechnology、ISME Journal等国际主流学术期刊上发表SCI论文20余篇，并在Current Opinion in Microb

第15讲  张瑞福
南京农业大学资源与环境科学学院教授，博士生导师，钟山首席教授。主要从事根际微生物与微生物肥料、农业有机废弃物微生物转化与有机肥料等方面的研究。

第16讲  陈桃
陈桃，华中农业大学植物科学技术学院，副教授。本硕博均毕业于华中农业大学生命科学技术学院，2012年获得华中农业大学理学博士学位，师从张忠明教授，从事共生固氮分子生物学研究。2012年7月至今一直在华中农业大学植物科学技术学院从事教学与科研工作，是姜道宏教授分子植物病理学团队的一员。2017年7月-2020年6月到密歇根州立大学何胜洋院士实验室做访问学者。

第17讲  王二涛
中国科学院植物生理生态研究所研究员，博士生导师，“国家杰出青年基金”获得者，主要从事豆科植物-根瘤共生固氮，植物-丛枝菌根真菌共生方面的研究。建立以脂肪酸为核心的植物-丛枝菌根真菌共生营养交换与调控的理论模型；发现菌根因子受体及受体复合，并解析了菌根因子信号转导途径等，相关研究成果发表在Science, Nature, Molecular Plant, The Plant Cell, Cell Research等国际主流学术期刊上，对植物-微生物共生研究领域有重要影响。目前任Science Bulletin, New Phytologist等学术期刊编委。获2014年“国家自然科学奖二等奖”，2018年“中国青年科技奖”，2019年“CSPB杰出青年科学家奖”和2020年“科学探索奖”等。

第18讲  孙波
中国科学院南京土壤研究所研究员，博导，中科院特聘研究员；江西鹰潭国家野外站站长、农业农村部耕地保育重点实验室常务副主任、中国植物营养与肥料学会副理事长。2016年起任国家“化肥农药减施增效”重点专项“耕地地力影响化肥养分利用的机制与调控”项目首席。